Кафедра высших растений
Биологического факультета Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова
Сравнительный анализ структуры хлоропластных геномов ряда представителей семейства Amaryllidaceae (либо на выбор: Dryopteridaceae, Compositae).
Руководитель: старший научный сотрудник Криницына А.А., научный сотрудник Сперанская А.С. ( комната 587, ankrina@gmail.com)
Данная работа ведется в рамках гранта РФФИ. Основной исследуемый вопрос: возникают ли какие-то наследуемые изменения в структуре хлоропластных геномов у растений, адаптирующихся в процессе эволюции к различным экологическим условиям. В текущем исследовании мы сравниваем равнинные виды с высокогорными.
В настоящее время у нас имеются результаты высокопроизводительного секвенированиях пДНК примерно 10 видов рода Allium, 4 видов рода Dryopteris, а также еще нескольких видов. В 2016 году мы собираемся осуществить секвенирование еще нескольких видов из сем. Сложноцветных.
Основные методы, которым мы можем обучить и которые будут использованы применять при выполнении этой работы:
- Выделение тотальной и хлоропластной ДНК растений
- ПЦР, подготовка образцов к секвенированию по Сэнгеру
- подготовка образцов к высокопроизводительному секвенированию
- анализ данных высокопроизводительного секвенирования.